Il microscopio è uno strumento ottico costituito da numerose parti ottiche e meccaniche. Le parti ottiche sono l'oculare e l'obiettivo. L'obiettivo ha il ruolo di ingrandire l'immagine osservata che verrà a sua volta ingrandita di nuovo dall'oculare. L'immagine raggiunge così l'occhio dell'osservatore che diventa parte integrante del sistema ottico del microscopio. I microscopi possono essere monoculari, binoculari o tronoculari. I microscopi binoculari consentono un'osservazione più naturale e meno affaticante per chi deve lavorare a lungo. I trinoculari, oltre ad avere i vantaggi dei binoculari, consentono l'aggiunta di fotocamere e videocamere per riprendere e fotografare le immagini dei preparati.